Издание получило решение Следственного комитета России о проведении дополнительной проверки. В решении указано, что Следственный комитет при Генпрокуратуре удовлетворил обращение главного редактора "Новой газеты" Дмитрия Муратова и отменил решение об отказе в возбуждении уголовного дела по факту смерти Щекочихина. Прокуратура отказывала с формулировкой "за отсутствием события преступления". Следственному управлению при Следственном комитете "поручено организовать дополнительную проверку, в ходе которой исследовать доводы", изложенные Муратовым.
Причинами обращения Муратова называлось то, что родственники Щекочихина так и не получили акта вскрытия. Кроме того, коллеги журналиста не уверены в выводах медицинской экспертизы о причинах его смерти. Они смогли переправить крупным зарубежным специалистам добытые ими образцы тканей и краткое заключение судебных медиков. Эксперты пришли к выводу, что сам диагноз, возможно, и правильный, однако о причинах его возникновения ничего не сказано. Еще одной причиной обращения послужило то, что из Генпрокуратуры были уволены несколько руководителей, прикрывавшие некоторые громкие дела, по которым вел свое расследование Щекочихин. В частности, Муратов назвал "дело "Трех китов" по контрабанде мебели, возобновлению которого во многом способствовал Щекочихин.
Обозреватель "Новой газеты" Юрий Щекочихин почувствовал недомогание 16 июня 2003 года, однако поехал в командировку в Рязань. По возвращении ему стало еще хуже. 21 июня он в тяжелейшем состоянии был доставлен в ЦКБ, а ночью 3 июля умер. Официальная причина его смерти - "тяжелая общая интоксикация".
