Изданию "Коммерсант" удалось установить, что рапорт о несанкционированном получении информации из системы "Магистраль" был подан сотрудниками УСБ ГУ МВД по Санкт-Петербургу в январе 2021 года. Проверка показала, что в базу данных по авиаперелетам 8 и 9 сентября 2020 года заходил майор полиции Петербурга (ФИО есть у редакции). Офицер якобы искал информацию о рейсах из Томска в Домодедово 20 и 21 августа 2020 года, затем выбрал рейс 2614 авиакомпании S7 "и получил персональные данные", которые "передал некоему лицу". По данному факту ГСУ СКР по СПб возбудило уголовное дело о превышении должностных полномочий (часть 3 статьи 286 УК РФ).
Этим же рейсом летел Алексей Навальный, когда ему стало плохо. Экипаж экстренно посадил самолет в Омске, оппозиционер был госпитализирован. Позднее удалось установить, что Навальный был отравлен ядом из группы "Новичок". Российские власти отрицают свою причастность к этому. Расследователям Bellingcat и издания The Insider при участии CNN и Der Spiegel удалось установить, что к попытке отравления могли быть причастны восемь специалистов с медицинским и химическим образованием, действовавших при поддержке Института криминалистики ФСБ. По данным расследователей, члены этой группы, чередуясь, следовали за Алексеем Навальным последние три года в поездках по тем городам России, где оппозиционер останавливался хотя бы на одну ночь.
Авторы расследования не скрывали, что сделали такие выводы на основе биллинга телефонных номеров и данных о перелетах предполагаемых отравителей, которые были получены на черном рынке.
В ФСБ заявили, что "так называемое расследование... представляет собой спланированную провокацию... осуществление которой не было бы возможным без организационной и технической поддержки иностранных спецслужб". В возбуждении уголовного дела об отравлении было отказано. Тем не менее следователи начали искать тех, кто мог продать оппозиционерам данные об авиаперелетах. Так, 19 января 2021 года стало известно, что в отношении самарского полицейского возбуждено уголовное дело о злоупотреблении должностными полномочиями. По данным источника РБК, речь идет об информации, упомянутой Bellingcat. Полицейский был отправлен под домашний арест; 26 февраля его продлили на три месяца.